光谱仪充分利用了狭缝高度方向入射的光线，从而较大地增强了QE65000的系统灵敏度。在海洋光学的光谱仪中，通过选择不同的狭缝宽度来控制进入光学平台的光强。而目前大部分的光谱仪都采用线性CCD探测器，所以从狭缝高度方向入射的光线不会被系统充分利用，而QE65000科研级光谱仪采用的是面阵CCD，因此能够采集到更多的光线，它非常适合亮度较低的荧光应用。
光谱仪的基本操作步骤：
1、打开红外光谱仪的电源开关。
2、点击电脑屏幕打开IRsolution工作站软件。
3、点击测定，使屏幕转到测定界面。之后初始化仪器。
4、制备溴化钾空白片和样品压片。
5、将压制好的溴化钾空白片(不含样品的溴化钾空片)放入光谱仪样品仓内的样品架上。
6、点击测定按钮下的背景按钮，输入光谱名称，确认采集参比背景光谱。
7、背景谱图采集完毕后，将待测样品片放入光谱仪内，关上仓盖。
8、软件可按要求对谱图进行各种分析处理，从文件菜单中选择打印，将谱图以不同形式打印出报告。
9、退出系统。
光谱仪的使用注意事项：
1、仪器一定要安装在稳定牢固的实验台上，远离振动源。
2、供试品测试完毕后应及时取出，长时间放置在样品室中会污染光学系统，引起性能下降。样品室应保持干燥，应及时更换干燥剂。
3、所用的试剂、试样保持干燥，用完后及时放入干燥器中。
4、在工作期间，不可中途断电。
5、压片模具及液体吸收池等红外附件，使用完后应及时擦拭干净，必要时清洗，保存在干燥器中，以免锈蚀。
6、光路中有激光，开机时严禁眼睛进入光路。
7、测定完毕，要及时做好仪器使用登记记录。
